1.合同金额。确认合同金额是否与相应项目相匹配，合同金额是否控制在相应项目额度内，确认超出部分是否已履行相应审批程序。检查合同正文中金额的计算是否准确，是否与合同所附数据一致，金额是否大小写一致。如果签订的合同是框架合同，要注意合同中约定的金额是否合理。
2.结算条款。确定合同结算条款是否符合企业信用管理规定，同时符合预付款、付款进度、承兑付款的管理要求。比如有的企业设备材料采购不使用预付款，而是根据合同执行进度分批支付货款，具体支付比例要根据供应商的信用等级来确定。如有特殊情况需要提前支付，需进行专项审计。确认合同结算方式(银行转账、银行汇票、现金支付等。)符合企业的相关规定。
3.税务相关事宜。确认合同条款，如税务负担、发票开具等是否符合国家税法要求。确认合同中约定的发票类型是否与合同的业务内容和性质一致。在财务审计过程中，应以合伙人机构所在地、劳务发生地和业务内容作为判断标准。涉及增值税业务的票据应标明开具增值税专用票或普通发票。如未明确约定发票类型，应注明乙方必须提供符合税法及甲方财务要求的正规税务发票 。
4.特殊事项。如果签订的合同是租赁合同，要判断租赁形式是否符合企业资产管理的范围。比如有的企业规定未经批准不得从事任何形式的融资租赁，而企业参与市场竞争的核心设备不允许以租赁方式收购资产。签订的合同为关联交易合同的，财务部应审查是否涉及关联交易，交易金额是否符合企业要求，合同金额是否在年度剩余关联交易金额范围内。如果签订的合同是捐赠赞助合同，财务部门应检查其交易的涉税事项是否符合企业所得税税前扣除的要求，非广告赞助费用和非公益性捐赠不在企业所得税前扣除。若签订的合同涉及保证金或保证金条款，财务部应对保证金或保证金收据的签发方式进行审核。
5.印花税。除以上四点外，还应根据合同业务性质和合同类型选择相应的印花税税目。特殊项目应出具审计意见。比如审计意见中要加上租赁合同，合同是经营租赁合同 文字。
